Mendeley Dekstop merupakan aplikasi Mendeley yang diinstal pada Dekstop (Windows atau MacOS) yang berfungsi untuk mengelola sitasi dan referensi pada manuscript dan dapat bekerja secara offline dan penyimpanan data pada hardisk PC. Mendeley Dekstop juga memiliki Plug in yang dapat diinstal pada Microsoft Word. Plug in ini berfungsi untuk mengelola sitasi dan bibliography secara otomatis ketika author menulis paper.
Beberapa hal yang dapat dilakukan pada Mendeley Desktop:
- Melakukan ekstraksi informasi detail (nama penulis, judul, nama judul, dan lain-lain) dari setiap referensi yang ditambahkan ke dalam Mendeley.
- Mencari referensi dengan cepat berdasarkan kata kunci pencarian tertentu. Dengan catatan, setiap referensi sudah pernah ditambahkan ke dalam Mendeley milik pengguna. Jika belum, maka pencarian dapat dilakukan secara online, dengan catatan ada koneksi internet di komputer.
- Membuat catatan tambahan (note) atau menandai (tag) setiap dokumen referensi yang pengguna miliki.
- Membuat Daftar Pustaka secara otomatis berdasarkan berbagai format, misalnya APA, Harvard, IEEE, dan lainnya.
- Melakukan pengacuan secara otomatis ketika menulis karya ilmiah di Microsoft Word, Wikipedia, 2010).